Medicii de la Compartimentul Chirurgie Toracică activează în cadrul Secției Clinice Chirurgie Oncologică II, de la etajul V al institutului. Chirurgia Toracică este ramura chirurgicală care se ocupă cu diagnosticul şi tratamentul afecţiunilor peretelui toracic şi pleurei, traheobronhopulmonare, mediastinului, pericardului, esofagului, diafragmului, precum şi ale graniţelor cervico-toracice şi toraco-abdominale.
Echipa medicală de la Institutul Regional de Oncologie practică următoarele intervenții chirurgicale:
Compartimentul Chirurgie Toracică dispune de 10 paturi din cadrul Secției Clinice Chirurgie Oncologică II dispune de 10 paturi. Intervențile chirurgicale care vizează toracele îmbunătățesc calitatea vieții și cresc speranța de viață în cazul pacienților oncologici.